Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TUBA3CQ13748 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TUBA3CQ13748 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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