Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBE2V1Q13404 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UBE2V1Q13404 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms