Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF6Q13247 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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