Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPA4Q13156 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms