Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP1Q12981 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms