Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP1B1Q10567 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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