Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms