Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GOLGA3Q08378 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GOLGA3Q08378 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GOLGA3Q08378 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms