Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DHX9Q08211 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms