Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXM1Q08050 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms