Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN1BQ07699 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms