Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFF3Q07654 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms