Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms