Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms