Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMF1P82094 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMF1P82094 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMF1P82094 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMF1P82094 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMF1P82094 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMF1P82094 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMF1P82094 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMF1P82094 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMF1P82094 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMF1P82094 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms