Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL20P78556 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL20P78556 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL20P78556 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL20P78556 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL20P78556 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL20P78556 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL20P78556 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL20P78556 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms