Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT85P78386 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT85P78386 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT85P78386 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT85P78386 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT85P78386 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT85P78386 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT85P78386 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT85P78386 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT85P78386 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT85P78386 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT85P78386 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT85P78386 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT85P78386 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT85P78386 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT85P78386 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT85P78386 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT85P78386 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT85P78386 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms