Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms