Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARF3P61204 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms