Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP1P56182 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP1P56182 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP1P56182 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms