Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLTPP55058 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLTPP55058 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLTPP55058 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms