Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPAP53621 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPAP53621 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPAP53621 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPAP53621 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPAP53621 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPAP53621 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPAP53621 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPAP53621 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPAP53621 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPAP53621 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPAP53621 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms