Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOSBP53539 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms