Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CAPZA1P52907 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPZA1P52907 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms