Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC34P49427 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC34P49427 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms