Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NESP48681 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NESP48681 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NESP48681 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NESP48681 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NESP48681 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NESP48681 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NESP48681 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NESP48681 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NESP48681 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NESP48681 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NESP48681 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
NESP48681 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
NESP48681 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NESP48681 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
NESP48681 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NESP48681 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NESP48681 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NESP48681 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NESP48681 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NESP48681 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NESP48681 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NESP48681 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NESP48681 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NESP48681 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms