Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL29P47914 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL29P47914 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms