Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBR1P36897 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms