Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX1P32242 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX1P32242 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX1P32242 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX1P32242 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX1P32242 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX1P32242 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX1P32242 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTX1P32242 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms