Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA7P31268 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA7P31268 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms