Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBL1P28749 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBL1P28749 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBL1P28749 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBL1P28749 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBL1P28749 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBL1P28749 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBL1P28749 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBL1P28749 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms