Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMBRP28336 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMBRP28336 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NMBRP28336 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMBRP28336 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NMBRP28336 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NMBRP28336 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NMBRP28336 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NMBRP28336 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NMBRP28336 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms