Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTF3P20783 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NTF3P20783 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NTF3P20783 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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