Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRHP20396 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRHP20396 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
TRHP20396 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRHP20396 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRHP20396 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TRHP20396 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRHP20396 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRHP20396 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRHP20396 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRHP20396 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRHP20396 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRHP20396 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRHP20396 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRHP20396 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRHP20396 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms