Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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