Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPI1P17947 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPI1P17947 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPI1P17947 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPI1P17947 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPI1P17947 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms