Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPGDP15428 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPGDP15428 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPGDP15428 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPGDP15428 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HPGDP15428 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HPGDP15428 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HPGDP15428 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HPGDP15428 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms