Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC5A1P13866 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC5A1P13866 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms