Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPSAP08865 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPSAP08865 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPSAP08865 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPSAP08865 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPSAP08865 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPSAP08865 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPSAP08865 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPSAP08865 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPSAP08865 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPSAP08865 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms