Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP3A4P08684 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms