Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HLA-DQB1P01920 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DQB1P01920 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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