Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms