Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCATO75600 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCATO75600 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCATO75600 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCATO75600 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCATO75600 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCATO75600 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCATO75600 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCATO75600 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCATO75600 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCATO75600 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCATO75600 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCATO75600 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms