Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F6O75461 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F6O75461 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F6O75461 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms