Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN2BO60939 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN2BO60939 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN2BO60939 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN2BO60939 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCN2BO60939 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms