Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSCO60682 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSCO60682 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSCO60682 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSCO60682 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSCO60682 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms