Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SOX15O60248 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1177.6 ms