Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAPO00193 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAPO00193 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAPO00193 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMAPO00193 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAPO00193 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAPO00193 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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