Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PATL2C9JE40 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms