Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV20-1A0A075B6N2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRBV20-1A0A075B6N2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRBV20-1A0A075B6N2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV20-1A0A075B6N2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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